โรงเรียนเซนต์เซบาสเตียนก่อตั้งขึ้นในปี พ.ศ. 1980 Mr. C. Rozario ผู้ก่อตั้งของเราเห็นความจำเป็นที่จะต้องให้การศึกษาแบบองค์รวมที่ดีแก่เด็กจำนวนมากในพื้นที่ท้องถิ่นและโดยรอบของ Seal Lane เขาก่อตั้งโรงเรียนเซนต์เซบาสเตียนเพื่อรำลึกถึงเซบาสเตียนโรซาริโอลูกชายคนที่สองของเขาที่เสียชีวิตไปตั้งแต่อายุยังน้อย โรงเรียนเริ่มต้นด้วยนักเรียน 5 คนและครู 2 คนในอพาร์ทเมนต์เช่าเล็ก ๆ ที่ Seal Lane และค่อยๆหลังจากได้มาซึ่งสถานที่ปัจจุบันที่ 14, Seal Lane, Kolkata 700015