राजा राममोहन राय अकादमी की स्थापना 1950 में मसूरी के कैनविले हाउस में लड़के और लड़कियों के लिए एक तैयारी बोर्डिंग स्कूल के रूप में की गई थी। इसे तब शिशुनिकेतन के रूप में जाना जाता था। यह विद्यालय शिक्षा के उन्नति के लिए सोसायटी के प्रबंधन के तहत तेजी से विकसित हुआ। 1960 में, सीनियर विंग को क्लेमेंट टाउन में अपने वर्तमान परिसर में स्थानांतरित कर दिया गया और 1965 में जूनियर विंग का पालन किया गया।