Institut Moravian di Rajpur, Dehradun didirikan pada tahun 1963 oleh Br Eliyah Thsetan Phunthsog ketika dia melakukan penyemakan Perjanjian Baru dalam bahasa Tibet untuk Bible Society of India. Selama ini dia bertemu dengan sejumlah pelarian Tibet yang baru saja melarikan diri dari tanah air mereka melintasi Himalaya. Apa yang berkembang selama bertahun-tahun adalah pekerjaan yang melibatkan sekolah, asrama dan program latihan vokasional. Institut ini bergabung dengan Majlis Peperiksaan ISC (Indian School Certificate), New Delhi sejak tahun 1978.